Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frg1P97376 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms