Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psme1P97371 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psme1P97371 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms