Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms