Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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