Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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