Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgcdP82347 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcdP82347 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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