Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms