Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Irx1P81068 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Irx1P81068 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms