Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptprn2P80560 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms