Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx3P70354 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms