Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad1P70340 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms