Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frat1P70339 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frat1P70339 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frat1P70339 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms