Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf6P70279 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms