Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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