Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snrpd3P62320 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms