Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snrpd1P62315 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Snrpd1P62315 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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