Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga11P61622 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga11P61622 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms