Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap25P60879 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms