Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ActbP60710 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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