Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr3bP59470 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr3bP59470 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr3bP59470 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms