Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms