Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhbdl3P58873 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms