Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms