Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dpf3P58269 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms