Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms