Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lim2P56563 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms