Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Atp5eP56382 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms