Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms