Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcanP55066 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcanP55066 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NcanP55066 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcanP55066 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms