Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PitpnbP53811 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms