Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms