Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms