Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms