Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp3P49194 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms