Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CitP49025 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CitP49025 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CitP49025 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CitP49025 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CitP49025 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CitP49025 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms