Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcd1P48410 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms