Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrprbP47758 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms