Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mmp9P41245 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mmp9P41245 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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