Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtlP38585 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtlP38585 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtlP38585 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms