Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HmgclP38060 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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HmgclP38060 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HmgclP38060 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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