Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfc1P35601 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfc1P35601 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms