Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpardP35396 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpardP35396 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpardP35396 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpardP35396 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms