Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab20P35295 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms