Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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