Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Saa4P31532 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms