Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms