Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc1P29341 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms