Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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