Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd10P28359 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms