Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms